IGN reporta que en una reciente entrevista, Miyamoto comentó unos “pequeños” cambios hechos a la versión para Wii de Twilight Princess. El más notorio de estos cambios está en el manejo del control, en esta versión los ataques con la espada se realizarán moviendo el control. Nintendo originalmente presentaba dudas de habilitar un tipo de control así, pues podría fatigar a los juegadores, pero parece que han cambiado de idea. Miyamoto, comentando al respecto dice que… “Una vez lo juegas de esta manera, se hace más interesante.”

Este cambio puede hacer que elegir entre la versión de GC y la de Wii, sea más fácil.